Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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GABRA6Q16445 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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GABRA6Q16445 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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