Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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