Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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