Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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