Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms