Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms