Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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