Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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