Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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