Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms