Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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