Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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