Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARHGEF5Q12774 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms