Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.2 ms