Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms