Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms