Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms