Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 DPP4-211ENST00000628861 433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC016831.6-201ENST00000604514 1517 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FAM86B2-201ENST00000262365 1268 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NARF-IT1-201ENST00000584012 769 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC00662-207ENST00000590677 883 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms