Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms