Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms