Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVK-16P61578 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms