Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms