Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms