Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TPTEP56180 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms