Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OXCT1P55809 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms