Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIRAP54198 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms