Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms