Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GTF2E2P29084 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GTF2E2P29084 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms