Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCND1P24385 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCND1P24385 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCND1P24385 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCND1P24385 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCND1P24385 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCND1P24385 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms