Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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