Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms