Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms