Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms