Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACAA1P09110 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms