Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
F13BP05160 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms