Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms