Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms