Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CFAP73A6NFT4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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