Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms