Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms