Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms