Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPP1R1BQ9UD71 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms