Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms