Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms