Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SERINC1Q9NRX5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms