Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KIAA1549Q9HCM3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms