Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms