Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms