Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP1Q9C000 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms