Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BCO2Q9BYV7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms